美國Charles Supper薄壁毛細管,超蛋白線材模型折彎機

Charles Supper? 公司 超蛋白線材模型折彎機


超級蛋白質絲模型彎曲機,
也被稱為拜倫的彎曲機,
可以制作一個整體的蛋白質-碳模型。

超蛋白線材模型折彎機是一種易于加工的設備α-通過在一
根連續長度的鋼棒上放置適當的彎曲度來建立蛋白質分子
的碳骨架模型。該模型可以在任何規模縮小到約4毫米/?.
在這種尺寸下,模型可以完全獨立,因此不需要外部支持
的網絡。它們足夠小,只需要很少的存儲空間,足夠堅固,
能夠經受住頻繁的搬運和研究。
目前已經有好幾種類型的蛋白質模型,但是它們都需要精確
地將大量的小片段連接在一起,因此構建的成本和難度限制
了它們的使用。幸運的是,bender產生的簡單的單件蛋白質
模型可以服務于三維模型最有價值的許多功能。它們以異常
清晰的方式展示了每個蛋白質的整體折疊模式,特別適合于
比較一個分子內或同源蛋白質之間結構相似的區域。這些模
型通過在骨架上添加配體和一些選定的側鏈,展示了酶活性
位點的三維幾何結構,這在生化實驗設計中是非常有用的。
這些骨干模型對于教學非常有用,既可以作為課堂展示,也
可以作為學生制作自己的蛋白質模型以供學習和保存的實驗
室練習。由于這些模型很小,而且可以快速構建,因此建立
每個已知蛋白質結構的模型是可行的。

彎刀是由Byron H. Rubin和Jane S. Richardson在杜克大學
開發的(在美國國家衛生研究院的支持下,Grant GM 15000)。

圖(1)紅發蛋白,顯示鐵原子及其四種半胱氨酸配體。模型是彎
從1/8 “鋼棒和鍍鎳。它大約5英寸高,比例尺為4毫米/?。

構建蛋白α-碳模型的彎折如下圖所示。該儀器由三個基本元素
組成:一組兩個桿夾,一個旋轉鐵砧,和一個直讀彎錘。通過接
合動夾,脫離固定夾,向前推進動夾,通過彎砧送出固定長度
0.125″或3mm的鋼條。該坐標系由沿蛋白質主干的每個殘基的
一個距離、一個二面角和一個彎曲角組成。連續的α -碳Cn-1和
Cn之間的距離由千分尺設置確定。始終保持桿在至少一個兩個
桿夾允許二面角相對彎曲作為一個固定的參考系被測量。如果
An ‘是Cn-2Cn-1Cn面與Cn-1CnCn+1面之間的局部二面角,
則彎砧鼓表盤上顯示的累積二面角An為

在彎曲錘表盤上讀取彎曲角度Bn,并略微超調以保證鋼棒的彈性。

為了保證儀器的使用壽命,彎曲砧和錘子以及其他受應力的零件已硬化洛氏45。

說明材料提供與每個彎管機時,裝運。詳細描述了彎曲模型的制
作過程。彎曲角度列表包括十個蛋白質(胰島素,紅蛋白,胰蛋白
酶抑制劑,高潛力鐵蛋白,細胞色素b5,細胞色素C,鯉魚肌原,
葡萄球菌核酸酶,碳酸酐酶,乳酸脫氫酶),并給出了截至1972年
5月出版的蛋白質坐標的文獻參考。

圖(2)核糖核酸酶S: S蛋白和S肽的主干在1/8”鋼棒和1/16”絲的
二硫鍵。模型是用彎管機制作的,尺寸為6毫米/?,直徑約為10英寸。


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