美國Charles Supper 超蛋白絲模型折彎機 Cat.#7145
Catalog # 7145
超蛋白絲模型折彎機
超級蛋白質金屬絲模型折彎機,也被稱為拜倫折彎機,將制作單件蛋白質α-碳模型。
Super-Protein Wire Model Bender(超級蛋白絲模型折彎機)是一種通過在一根連續長度的鋼棒中放置適當的折彎來輕松制作蛋白質分子的α-碳骨架模型的設備。這些模型可以按任何比例制作,縮小到大約4mm/?。在這種規模下,模型可以完全獨立,因此不需要外部支持網絡。它們足夠小,只需要很少的存儲空間,足夠堅固,能夠經受住頻繁的搬運和研究。
目前已經有好幾種類型的蛋白質模型可用,但它們都涉及將大量小片段精確地連接在一起,因此構建的成本和難度限制了它們的使用。幸運的是,bender生產的簡單的單件蛋白質模型可以實現許多功能,三維模型對這些功能最有價值。它們異常清晰地展示了每種蛋白質的整體折疊模式,特別適合于比較一個分子內或同源蛋白質之間結構相似的區域。通過在主鏈上添加配體和一些選定的側鏈,這些模型顯示了酶活性位點的三維幾何結構,這在生化實驗的設計中通常很有用。這些骨干模型對于教學目的很有用,無論是作為課堂展示還是作為實驗室練習,學生可以制作自己的蛋白質模型進行學習和保存。由于這些模型很小,而且可以快速構建,因此構建每個已知蛋白質結構的模型是可行的。
這款彎管機由杜克大學的Byron H. Rubin和 Jane S. Richardson(獲得美國國立衛生研究院(National Institutes of Health)的資助,通用汽車公司Grant GM 15000)。
圖(1)Rubredoxin,顯示了鐵原子及其四個半胱氨酸配體。該模型由1/8″的鋼棒彎曲并鍍鎳。它大約有五英寸高,比例為4mm/?。
構建蛋白質α-碳模型的折彎機如下所示。該儀器由三個基本元件組成:一套兩個桿夾、一個旋轉鐵砧和一個直讀彎曲錘。0.125的固定長度“或通過接合移動夾鉗,分離固定夾鉗,并將移動夾鉗向前移動至停止位置,將3mm的鋼條送入彎曲砧座。坐標系由距離、二面角和沿蛋白質主鏈的每個殘余物的彎曲角組成。連續α碳Cn-1和Cn之間的距離由測微計設置確定。始終將桿固定在兩個桿夾中的至少一個中,可以相對于折彎機測量二面角,作為固定的參考框架。如果An’是Cn-2Cn-1Cn平面和Cn-1CnCn+1平面之間的局部二面角,則彎曲砧筒刻度盤上顯示的累積二面角An為
通過彎曲錘刻度盤上讀取的彎曲角度Bn彎曲桿,稍微過沖以允許鋼桿的彈性。
為了確保儀器壽命,彎曲砧和錘子以及其他受應力的零件已硬化至洛氏45。
裝運時,每個折彎機都提供了說明材料。詳細描述了彎曲模型的過程。列出了十種蛋白質(胰島素、紅細胞氧還蛋白、胰蛋白酶抑制劑、高電位鐵蛋白、細胞色素b5、細胞色素C、鯉魚肌原、葡萄球菌核酸酶、碳酸酐酶和乳酸脫氫酶)的彎曲角度列表,并提供了自1972年5月以來已發表的蛋白質坐標集的文獻參考。
圖(2)核糖核酸酶S:S蛋白和S肽的主鏈位于1/8“鋼棒中,二硫鍵位于1/16”金屬絲中。該模型由折彎機制成,尺寸為6毫米/?,直徑約10英寸。(點擊查看圖)